Η ένδοξη ιστορία του ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΥ ξεκινά το 1930, χρονιά ίδρυσης της ιστορικής ομάδας της Παλλεβαδειακής.

Το 1961 η Παλλεβαδειακή απορρόφησε το σωματείο του Τροφωνίου, ομάδα που είχε πάρει το όνομά της από το ξακουστό μαντείο της αρχαιότητας.

Οι φίλαθλοι της Παλλεβαδειακής και του Τροφωνίου, παρά την αντιπαλότητα που είχαν μεταξύ τους, αποδέχτηκαν την ένωση και έτσι δημιουργήθηκε ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ, που έμελε να γίνει ο καλύτερος πρεσβευτής της Λιβαδειάς σε ολόκληρη τη χώρα. Ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ αποτελεί τη μεγαλύτερη δύναμη της Στερεάς Ελλάδας στον ποδοσφαιρικό χάρτη της Ελλάδας.

Το σήμα της ομάδας έχει μπλε και πράσινες κάθετες ρίγες. Προέρχεται από τα χρώματα της Παλλεβαδειακής (πράσινο) και του Τροφωνίου (μπλε).

Κοινό χρώμα και των δύο ομάδων ήταν το λευκό, το οποίο αποτελούσε και το βασικό χρώμα του ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΥ στα πρώτα χρόνια της ίδρυσής του.

Μεγάλη διάκριση του ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΥ αποτελεί η πρόκριση του στους 4 του Κυπέλλου Ελλάδας το 1986, όπου αποκλείστηκε από τη Λάρισα.

Χρονιά σταθμός είναι το 1987, όταν ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ βρίσκεται για πρώτη φορά στην ιστορία του στα σαλόνια της Α΄ Εθνικής Κατηγορίας.

Η ομάδα παρέμεινε για τέσσερις σεζόν στην Α΄ Εθνική, που αποτελεί ρεκόρ παραμονής μέχρι σήμερα. Στη συνέχεια αγωνίζεται για δύο σεζόν στη Β΄ Εθνική και επιστρέφει στην Α΄, όπου και θα αγωνιστεί για δύο σεζόν. Από το 1995 μέχρι το 1998 ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ θα αγωνιστεί στη Β΄ Εθνική, κατηγορία στην οποία έχει και τις περισσότερες συμμετοχές του.

Έπειτα έρχονται τα «δύσκολα χρόνια»: μία σεζόν στη Γ΄ Εθνική και τρεις στη Δ΄. Ακολουθεί η ανάκαμψη, γρήγορο πέρασμα από τη Γ΄ Εθνική και άνοδος στη Β΄ το 2003. Ακολουθούν δύο σεζόν στη Β΄ και το 2005 η ομάδα πραγματοποιεί τη μεγάλη επιστροφή στην Α΄ Εθνική. Δε θα μπορέσει να παραμείνει στην κατηγορία αλλά θα επιστρέψει άμεσα, έπειτα από μία σεζόν, στη μεγάλη κατηγορία που έχει ήδη πάρει τη σημερινή της μορφή, το πρωτάθλημα δηλαδή της Super League.

Έπειτα από τρεις διαδοχικές σεζόν στη Super League, ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ υποβιβάζεται και την περίοδο 2010-2011 αγωνίζεται στη Football League (Β’ Εθνική). Τη σεζόν 2011-2012 ο ΛΕΒΑΔΕΙΑΚΟΣ λαμβάνει μέρος στο Πρωτάθλημα της Super League, όπου και τερματίζει στην 7η θέση του βαθμολογικού πίνακα, την καλύτερη μέχρι στιγμής στην ιστορία του στη μεγάλη κατηγορία, όπου συνεχίζει και τη φετινή αγωνιστική περίοδο στοχεύοντας σε μία ακόμη καλύτερη πορεία.